Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRF1P10914 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRF1P10914 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IRF1P10914 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF1P10914 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF1P10914 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF1P10914 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF1P10914 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF1P10914 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms