Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUP10909 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUP10909 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUP10909 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUP10909 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUP10909 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUP10909 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms