Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00869P0C866 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00869P0C866 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms