Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPN1P04843 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPN1P04843 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPN1P04843 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPN1P04843 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPN1P04843 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms