Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ASS1P00966 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ASS1P00966 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ASS1P00966 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ASS1P00966 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ASS1P00966 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ASS1P00966 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms