Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MBD3O95983 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MBD3O95983 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD3O95983 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD3O95983 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD3O95983 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MBD3O95983 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD3O95983 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD3O95983 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms