Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms