Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PITX3O75364 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PITX3O75364 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PITX3O75364 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PITX3O75364 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX3O75364 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms