Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3BO75182 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms