Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMFO60524 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEMFO60524 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEMFO60524 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEMFO60524 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEMFO60524 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEMFO60524 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEMFO60524 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEMFO60524 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEMFO60524 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEMFO60524 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEMFO60524 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEMFO60524 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEMFO60524 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEMFO60524 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEMFO60524 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms