Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PDE6DO43924 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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