Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTN4O43707 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms