Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DENRO43583 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DENRO43583 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DENRO43583 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DENRO43583 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DENRO43583 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DENRO43583 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms