Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SETD1AO15047 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SETD1AO15047 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms