Protein–RNA interactions for Protein: O00590

ACKR2, Atypical chemokine receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR2O00590 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACKR2O00590 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms