Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PES1O00541 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PES1O00541 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PES1O00541 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PES1O00541 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PES1O00541 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PES1O00541 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PES1O00541 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PES1O00541 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PES1O00541 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PES1O00541 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PES1O00541 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PES1O00541 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PES1O00541 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PES1O00541 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PES1O00541 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PES1O00541 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PES1O00541 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms