Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3C2AO00443 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms