Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP2O00295 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP2O00295 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP2O00295 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP2O00295 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TULP2O00295 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TULP2O00295 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms