Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms