Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PMS2P5A8MQ11 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PMS2P5A8MQ11 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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