Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3P2A8K0S8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEIS3P2A8K0S8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms