Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C5orf51A6NDU8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms