Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT87PA6NCN2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRT87PA6NCN2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms