Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00862A6NCI5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00862A6NCI5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms