Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IRGMA1A4Y4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRGMA1A4Y4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms