Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A3GALT2U3KPV4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms