Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX13Q9Y5W8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms