Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KIF3AQ9Y496 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIF3AQ9Y496 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms