Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP11Q9Y3A2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP11Q9Y3A2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms