Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIF3AQ9Y2N7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms