Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms