Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms