Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF608Q9ULD9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF608Q9ULD9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF608Q9ULD9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF608Q9ULD9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF608Q9ULD9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms