Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN1Q9ULB1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms