Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2LQ9UL33 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms