Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PARP4Q9UKK3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PARP4Q9UKK3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP4Q9UKK3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms