Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLXNA1Q9UIW2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLXNA1Q9UIW2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms