Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATPIF1Q9UII2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATPIF1Q9UII2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms