Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VTI1BQ9UEU0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VTI1BQ9UEU0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms