Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DBF4Q9UBU7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DBF4Q9UBU7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms