Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN3Q9P232 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN3Q9P232 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms