Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDP1Q9P0J1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDP1Q9P0J1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms