Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNOT2Q9NZN8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNOT2Q9NZN8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms