Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EHD3Q9NZN3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms