Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms