Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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RRN3Q9NYV6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RRN3Q9NYV6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RRN3Q9NYV6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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