Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLDND1Q9NY35 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDND1Q9NY35 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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