Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNIP2Q9NS61 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms