Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BIN3Q9NQY0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BIN3Q9NQY0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms