Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNGB3Q9NQW8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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